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拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

r语言文章/教程  2023-03-08 12:140

原文链接: http://tecdat.cn/?p=14528

 

 

在当我们缺少值时,系统会告诉我用-1代替,然后添加一个指示符,该变量等于-1。这样就可以不删除变量或观测值。

我们在这里模拟数据,然后根据模型生成数据。未定义将转换为NA。一般建议是将缺失值替换为-1,然后拟合未定义的模型。默认情况下,R的策略是删除缺失值。如果未定义50%,则缺少数据,将删除一半的行

  1.  
    n=1000
  2.  
    x1=runif(n)
  3.  
    x2=runif(n)
  4.  
    e=rnorm(n,.2)
  5.  
    y=1+2*x1-x2+e
  6.  
    alpha=.05
  7.  
    indice=sample(1:n,size=round(n*alpha))
  8.  
    base=data.frame(y=y,x1=x1)
  9.  
    base$x1[indice]=NA
  10.  
    reg=lm(y~x1+x2,data=base)
 

我们模拟10,000,然后看看未定义的分布,

  1.  
    m=10000
  2.  
    B=rep(NA,m)
  3.  
     
  4.  
     
  5.  
     
  6.  
     
  7.  
     
  8.  
     
  9.  
     
  10.  
    hist(B,probability=TRUE,col=rgb(0,0,1,.4),border="white",xlab="missing values = 50%")
  11.  
    lines(density(B),lwd=2,col="blue")
  12.  
    abline(v=2,lty=2,col="red")
 

拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

 

当然,丢失值的比率较低-丢失的观测值较少,因此估计量的方差较小。

拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

 

现在让我们尝试以下策略:用固定的数值替换缺失的值,并添加一个指标,

  1.  
    B=rep(NA,m)
  2.  
     
  3.  
     
  4.  
     
  5.  
     
  6.  
     
  7.  
     
  8.  
    hist(B,probability=TRUE,col=rgb(0,0,1,.4),border="white")
  9.  
    lines(density(B),lwd=2,col="blue")
  10.  
    abline(v=2,lty=2,col="red")

 

拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

 

不会有太大变化,遗漏值的比率下降到5%,

拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

 

例如仍有5%的缺失值,我们有

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如果我们查看样本,尤其是未定义的点,则会观察到

拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

 

缺失值是完全独立地随机选择的,

  1.  
    x1=runif(n)
  2.  
     
  3.  
     
  4.  
     
  5.  
     
  6.  
     
  7.  
     
  8.  
    plot(x1,y,col=clr)

 

拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

 

(此处缺失值的1/3为红色)。但可以假设缺失值的最大值,例如,

  1.  
    x1=runif(n)
  2.  
     
  3.  
     
  4.  
     
  5.  
     
  6.  
     
  7.  
     
  8.  
    clr=rep("black",n)
  9.  
    clr[indice]="red"
  10.  
    plot(x1,y,col=clr)
 

拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

 

有人可能想知道,估计量会给出什么?

拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

 

它变化不大,但是如果仔细观察,我们会有更多差异。如果未定义变量会发生什么,

  1.  
     
  2.  
     
  3.  
    for(s in 1:m){
  4.  
     
  5.  
     
  6.  
     
  7.  
     
  8.  
     
  9.  
     
  10.  
     
  11.  
     
  12.  
     
  13.  
     
  14.  
    base$x1[indice]=-1
  15.  
    reg=lm(y~x1+x2+I(x1==(-1)),data=base)
  16.  
    B[s]=coefficients(reg)[2]
  17.  
    }
  18.  
     
 

拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

 

这次,我们有一个有偏差的估计量。

  1.  
    set.seed(1)
  2.  
     
  3.  
     
  4.  
     
  5.  
     
  6.  
     
  7.  
     
  8.  
    indice=sample(1:n,size=round(n*alpha),prob = x1^3)
  9.  
     
  10.  
    base$x1[indice]=-1
  11.  
     
  12.  
     
  13.  
     
  14.  
     
  15.  
    coefficients(reg1)
  16.  
    (Intercept) x1 x2 I(x1 == (-1))TRUE
  17.  
    1.0988005 1.7454385 -0.5149477 3.1000668
  18.  
    base$x1[indice]=NA
  19.  
     
  20.  
     
  21.  
    coefficients(reg2)
  22.  
    (Intercept) x1 x2
  23.  
    1.1123953 1.8612882 -0.6548206
 

正如我所说的,一种更好的方法是推算。这个想法是为未定义的缺失预测值预测。最简单的方法是创建一个线性模型,并根据非缺失值进行校准。然后在此新基础上估算模型。

  1.  
    for(s in 1:m){
  2.  
     
  3.  
     
  4.  
     
  5.  
     
  6.  
     
  7.  
     
  8.  
    base$x1[indice]=NA
  9.  
    reg0=lm(x1~x2,data=base[-indice,])
  10.  
    base$x1[indice]=predict(reg0,newdata=base[indice,])
  11.  
    reg=lm(y~x1+x2,data=base)
  12.  
     
  13.  
     
  14.  
     
  15.  
     
  16.  
    }
  17.  
    hist(B,probability=TRUE,col=rgb(0,0,1,.4),border="white")
  18.  
    lines(density(B),lwd=2,col="blue")
  19.  
    abline(v=2,lty=2,col="red")
 

 

拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

在数字示例中,我们得到

  1.  
    base$x1[indice]=NA
  2.  
     
  3.  
     
  4.  
     
  5.  
     
  6.  
     
  7.  
    coefficients(reg3)
  8.  
    (Intercept) x1 x2
  9.  
    1.1593298 1.8612882 -0.6320339
 

这种方法至少能够纠正偏差

然后,如果仔细观察,我们获得与第一种方法完全相同的值,该方法包括删除缺少值的行。

  1.  
     
  2.  
     
  3.  
    Coefficients:
  4.  
    Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
  5.  
    (Intercept) 1.15933 0.06649 17.435 < 2e-16 ***
  6.  
    x1 1.86129 0.21967 8.473 < 2e-16 ***
  7.  
    x2 -0.63203 0.20148 -3.137 0.00176 **
  8.  
    ---
  9.  
    Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
  10.  
     
  11.  
    Residual standard error: 1.051 on 997 degrees of freedom
  12.  
    Multiple R-squared: 0.1094, Adjusted R-squared: 0.1076
  13.  
    F-statistic: 61.23 on 2 and 997 DF, p-value: < 2.2e-16
  14.  
     
  15.  
     
  16.  
     
  17.  
    Coefficients: Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
  18.  
    (Intercept) 1.11240 0.06878 16.173 < 2e-16 ***
  19.  
    x1 1.86129 0.21666 8.591 < 2e-16 ***
  20.  
    x2 -0.65482 0.20820 -3.145 0.00172 **
  21.  
    ---
  22.  
    Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
  23.  
     
  24.  
    Residual standard error: 1.037 on 797 degrees of freedom
  25.  
    (200 observations deleted due to missingness)
  26.  
    Multiple R-squared: 0.1223, Adjusted R-squared: 0.12
  27.  
    F-statistic: 55.5 on 2 and 797 DF, p-value: < 2.2e-16
 

除了进行线性回归外,还可以使用另一种插补方法。

在模拟的基础上,我们获得

  1.  
     
  2.  
     
  3.  
    for(j in indice) base0$x1[j]=kpp(j,base0,k=5)
  4.  
    reg4=lm(y~x1+x2,data=base)
  5.  
    coefficients(reg4)
  6.  
    (Intercept) x1 x2
  7.  
    1.197944 1.804220 -0.806766
 

如果我们看一下10,000个模拟中的样子,就会发现

  1.  
    for(s in 1:m){
  2.  
     
  3.  
     
  4.  
     
  5.  
     
  6.  
     
  7.  
     
  8.  
     
  9.  
    base0=base
  10.  
    for(j in indice) base0$x1[j]=kpp(j,base0,k=5)
  11.  
    reg=lm(y~x1+x2,data=base0)
  12.  
    B[s]=coefficients(reg)[2]
  13.  
    }
  14.  
    hist(B,probability=TRUE,col=rgb(0,0,1,.4),border="white")
  15.  
    lines(density(B),lwd=2,col="blue")
  16.  
    abline(v=2,lty=2,col="red")
 

拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

 

这里的偏差似乎比没有插补时要弱一些,换句话说,在我看来,插补方法似乎比旨在用任意值替换NA并在回归中添加指标的策略更强大。

 拓端tecdat|R语言缺失值的处理:线性回归模型插补

参考文献

1.用SPSS估计HLM层次线性模型模型

2.R语言线性判别分析(LDA),二次判别分析(QDA)和正则判别分析(RDA)

3.基于R语言的lmer混合线性回归模型

4.R语言Gibbs抽样的贝叶斯简单线性回归仿真分析

5.在r语言中使用GAM(广义相加模型)进行电力负荷时间序列分析

6.使用SAS,Stata,HLM,R,SPSS和Mplus的分层线性模型HLM

7.R语言中的岭回归、套索回归、主成分回归:线性模型选择和正则化

8.R语言用线性回归模型预测空气质量臭氧数据

9.R语言分层线性模型案例

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